擅自转租房屋的处理方式是看出租人的选择，出租人同意转租的，可以转租；出租人不同意转租的，可以解除合同。如果承租人将房屋转租后，出租人在知道或应当知道的情况下六个月无异议，视为同意转租。法律依据：2021年1月1日生效的《民法典》第一百八十六条因当事人一方的违约行为，损害对方人身权益、财产权益的，受损害方有权选择请求其承担违约责任或者侵权责任。第七百一十六条承租人经出租人同意，可以将租赁物转租给第三人。承租人转租的，承租人与出租人之间的租赁合同继续有效；第三人造成租赁物损失的，承租人应当赔偿损失。承租人未经出租人同意转租的，出租人可以解除合同。第七百一十八条出租人知道或者应当知道承租人转租，但是在六个月内未提出异议的，视为出租人同意转租。
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承租人违约问题需要按照合同约定处理，当事人一方不履行合同义务或者履行合同义务不符合约定的，应当承担继续履行、采取补救措施或者赔偿损失等违约责任。当事人一方明确表示或者以自己的行为表明不履行合同义务的，对方可以在履行期限届满之前要求其承担违约责任。双方协商不成，可诉讼处理。
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一般来说，承租人擅自转租的，双方按照租赁合同的约定处理，赔偿约定的金额，如果协商不成，可到法院提起诉讼。